La Colombie a une géographie très différente d’une région à l’autre, elle abrite une nature et une faune tout aussi diversifiées. Avec deux côtes sur des océans différents ainsi que la célèbre chaîne de montagne des Andes et une partie de la forêt amazonienne, le pays offre de nombreuses possibilités de découvrir une flore et une faune uniques.
Si il existe quelques animaux dangereux en Colombie qui attire les plus curieux, il s’agit avant tout d’une destination privilégiée des observateurs d'oiseaux. La Colombie abrite plus de 1 800 espèces d'oiseaux. Ce chiffre est supérieur au nombre d'espèces d'oiseaux que l'on trouve en Amérique du Nord et en Europe réunies. L'oiseau national de la Colombie est le condor des Andes qui, naturellement, habite la Cordillère des Andes. Le condor est l'un des plus grands oiseaux du monde et son envergure peut atteindre 3,2 m.
Outre les oiseaux, la Colombie abrite également plus de 450 espèces de mammifères. Sur ces 450 espèces, environ 22 % sont classées comme étant en danger ou en danger critique d'extinction. Il est intéressant de noter que la Colombie possède le plus grand nombre de mammifères terrestres au monde. Parmi les animaux les plus communs que l'on trouve en Colombie figurent les fourmiliers, les paresseux, les tapirs, les ours à lunettes, les cerfs, les capybaras, les pumas, les jaguars et plusieurs espèces de singes.
Si la population de mammifères terrestres est importante dans le pays, les deux côtes de la Colombie, l'une sur l'océan Pacifique et l'autre sur les Caraïbes, font que les eaux qui entourent le pays abritent une vie marine diversifiée. Alors que la Colombie commence seulement à devenir une destination touristique populaire, sa côte Pacifique est un véritable joyau caché qui offre certaines des meilleures possibilités d'observation des baleines au monde. Les baleines à bosse y sont fréquentes et l'isolement de la région offre une expérience incroyablement unique. Dans le département de Chocó, sur la côte nord des Caraïbes, les tortues luths sont des visiteurs fréquents qui reviennent chaque année pour pondre leurs œufs. La Colombie abrite l'île de Malpelo, une réserve naturelle et un site classé au patrimoine mondial de l'UNESCO, située à 378 km du continent. Malpelo offre aux visiteurs d'incroyables aventures de plongée, car la région est connue pour sa population unique de requins, dont des centaines de requins-marteaux et de requins soyeux.
Afin de préserver la faune remarquable et les écosystèmes fragiles du pays, un réseau de zones protégées a été établi au fil des ans. En 2013, on comptait cinquante-six zones désignées qui ont été classées comme parcs naturels nationaux, sanctuaires de la flore et de la faune, réserves nationales, promenades et zones naturelles uniques. Ces différentes régions représentent plus de 10 % du pays. Deux des parcs nationaux les plus populaires de Colombie sont le parc naturel national des coraux de Rosario et San Bernardo et le parc naturel national de Tayrona. Le parc de Rosario et San Bernardo a été créé en 1977 afin de protéger les récifs coralliens colorés et l'écosystème sous-marin qui y existe. C'est le seul parc sous-marin du pays qui compte 52 espèces de coraux et 215 espèces de poissons. Le parc naturel national de Tayrona a été désigné en 1969 pour préserver l'intégrité biologique et archéologique de la région. Populaire auprès des amateurs d'oiseaux, la région abrite plus de 300 espèces d'oiseaux ainsi que plus de 100 espèces de mammifères.
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